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《Cell》

惊呆吃瓜群众!一个基因变异与5种血管疾病存在关联

PMID:

题目:

AGeneticVariantAssociatedwithFiveVascularDiseasesIsaDistalRegulatorofEndothelin-GeneExpression

背景:

全基因组关联研究提示PHACTR(6p24)上的一种常见变异与冠状动脉疾病和四种其他的血管疾病:偏头痛、颈部动脉夹层、肌纤维发育不良和高血压存在显著关联。

研究内容:

本研究利用来自CARDIOGRAMplusC4D联盟(CARDIOGRAMplusC4Dconsortium)将近20万人的数据对6p24这个关联区域进行finemapping精细定位,最终定位出rs这个SNP(与EDN基因相隔几十万个碱基的一个非编码SNP)是心血管疾病的一个最强的风险因素(P=.8*0-42)。基于英国生物样本库中的名欧洲血统人群表型数据开展的表型GWAS进一步提示rs(低频等位基因G的频率为0.36)与冠状动脉疾病风险存在关联。但有趣的是,这个位点G等位基因可以增加冠状动脉疾病和动脉钙化的风险,但会降低偏头痛、颈部动脉夹层、肌纤维发育不良和高血压的发病风险。

为了确定这个位点的功能,研究人员随后在人多能性干细胞中利用CRISPR/Cas9基因编辑剔除rs位点处的88bpDNA,随后将这些干细胞转化为血管细胞。研究结果发现,这个区域剔除后,周围M区域内,只有EDN基因的表达在血管细胞中显著上调了。EDN基因编码的内皮素-(endothelin-,EDN)可以促进血管收缩和动脉硬化。更重要的是,99名健康人血液样品开展的分析证实rs位点上的G等位基因与更高水平的大内皮素-(Bigendothelin-,ET-)相关联。ET-是EDN的前体蛋白。

进一步基于等位基因特异性的CRISPR/Cas9基因编辑技术和RNA测序,证实了该位点对EDN基因表达的调控作用。由于该位点和EDN基因相距很远,研究者怀疑可能存在3D染色质拓扑结果,但后续的4C-Seq实验并没有证实这一假设。

研究结论:

rs的G碱基促进EDN基因表达,增加ET-产生,进而可能增加冠状动脉疾病的发生风险,但降低了偏头痛、颈部动脉夹层、肌纤维发育不良和高血压的发生风险。但由于rs与EDN基因在物理上相隔较远,它如何调节这个基因的活性需要进一步探究。这项研究的最大价值是鉴定出EDN是多种血管疾病的一个核心基因。”

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《JAmCollCardiol》

“特殊”人类的罕见基因变异或可让千万人收益

PMID:

题目:ANGPTL3DeficiencyandProtectionAgainstCoronaryArteryDisease.

背景:

AnnaFeurer女士在一次公司活动中意外发现自己的甘油三脂,低密度脂蛋白(LDL)和高密度脂蛋白(HDL)水平都极低,显著低于正常人群(图片来源:《NewYorkTimes》)。

这位特殊的女性很快因为血脂水平的异常获得了研究者的

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